截至2019年末，南陵县拥有各类卫生机构316个（含村卫生室），其中，医院、卫生院16个，疾病控制中心1个，妇幼保健院1所,社区卫生服务中心1个，专科疾病防治院1个。卫生机构拥有床位1596张，其中医院、卫生院1067张。有卫生技术人员2485人，其中执业（助理）医生959人，注册护士1024人。

　　2019年8月，入选为紧密型县域医共体建设试点县。